老鼠、苍蝇、蟑螂对食品生产的危害很大，食品经它们爬过或者啃咬后，有的带上病毒，有的带上寄生虫，有的带上难闻的气味，失去其固有的色、香、味、形等，造成食品的污染和损失。它们还可能携带病菌传播疾病。食品生产企业必须具备防鼠、防虫设施。
（1）防鼠设施。防鼠必须采取综合措施，堵死环境中和建筑物内的鼠穴，断绝鼠食来源。对老鼠进入建筑物的通道，如地板下的水道、通风孔、风扇入口、地基下水道口都应设置防鼠网。老鼠几乎无孔不入，因此，食品生产经营企业要有完备的防鼠设施。
（2）防蟑螂设施。防蟑螂主要通过改变环境来实施。消除蟑螂的生活环境，即堵塞各种孔、洞、缝，特别是对于水池、热水器周围的孔、洞、缝隙要特别注意，因为这些地方离水源近，温度也较适宜，是最容易孳生蟑螂的地方。在车间、食堂等场所的下水道中安置金属丝网，防止蟑螂自下水道侵入。建立严格的物品清扫、洗刷制度，保管好食品和垃圾，不给蟑螂提供生活栖息和觅食场所。
（3）防蝇设施。食品生产企业应在车间设置纱窗、纱门和防蝇风帘以防苍蝇随货物进入车间。有条件的安装灯光诱蝇装置及电动捕蝇装置。防蝇措施的关键就是消除蝇类的孳生源。由于厨房垃圾、食品工厂中的原料残渣、中间产品残渣和制品的废弃物，以及原料和制品产生的食品废弃物，都是蝇的孳生源，食品生产企业要将食品下脚料、垃圾放在密闭的垃圾箱内，且保持垃圾箱外壁清洁。同时要做到工完场清，保存好各类食品原料与成品，及时清除生活垃圾，并进行无害化处理。
