暖通空调系统必须满足实验室研究要求。除对温度、湿度需严格控制外，需有足够的通风量处理烟尘、异味、空气中污物，满足烟罩通风以及实验室内热负荷要求。同时必须充分考虑系统的可靠性并考虑富裕量。不同性质区域需保证不同的相对压力,并要根据相关标准从长远上考虑节能。实验室中间操作罩口NC最大值不宜超过50dB，除非设备本身允许外，NC一般不宜超过60 dB。
暖通空调、水、电、照明设备需根据可有效利用能源的原则进行选择，同时应易于控制管理。防结露最小保温厚度需满足节能标准并参考国内相关推荐值。建筑围护材料必须保证居住者的健康与安全，建议选用环保节能材料。所有耗能系统及部件要进行全程控制管理，是否采用热回收应进行相应的比较评价。
通过对实验室设备的维护费用的经济分析，选用不同的暖通空调系统。经济分析应有足够的数据进行经济性、能效比的全面计算。经济分析主要包括工程初投资、能耗、运行费用、系统可靠性、适应性等方面分析比较。每个系统的选择需满足运行的灵活、可靠、易于维护并预留余量，工程总投资内包含维护费用。
实验室内通风、采光、温度、湿度、清洁度等均应达到实验室的环境要求，实验室应给人留下整洁、美观、舒畅的观感。(补充：通风设施一般有3种，分为全室通风、局部排气罩和通风柜。全室通风采用排气扇或者通风井，换气次数为5次/小时。局部排气罩一般安装在大型仪器发生有害气体的上方。通风柜是一种局部排风设备。内有加热源、气源、水源、照明等装置。风机一般安装在顶层，排气管高于屋顶2M以上。通风柜一般放置在空气流动较小的地方，不宜靠近门窗。
